温州密印寺，俗称头陀寺，初建于隋唐间，后汉乾祐二年（公元949）改创，坐落于州南二十五里头陀山麓。山以其形“锐而圆顶，下瞰诸山，如老僧踞坐说法”而名，一云玄觉大师“先实栖迟抖擞于此”所繇称（周应期《重建头陀密印禅寺碑记》）。
头陀寺为玄觉祖庭，记载已久。在宋，有隆兴元年（1163）进士、英州知府余闳《头陀山永嘉祖庭赏寺僧法传画牛》诗（见《余氏家录》）；入明，《弘治温州府志》卷三尤明确记载：“头陀山，宿觉剪发于此。” 佛门著作中亦有相同记载，如明释石奇，便认定密印寺为“永嘉祖道场”，称玄觉为“本山真觉大师”（《雪窦石奇禅师语录》卷六）。民国初年，高僧印光也说；“头陀山密印寺，即唐一宿觉道场也”（《印光法师文钞·法幢和尚传略》）。
玄觉祖庭之兴，先是在晚唐五代时，已然得到吴越王支持，明末清初，则因瑞安林增志和昆阳余孔谦等人合力，而得重光。清雍正十一年（1733），勅封永嘉宿觉为洞明妙智禅师，命以祖庭振兴宿觉道场，并改寺名为妙智禅寺（见《十国春秋》《佛祖统纪》《雪窦石奇禅师语录》《雍正实录》《乾隆温州府志》）。之后，禅籍和私家笔记，多有称密印寺为妙智寺的。但在《乾隆温州府志》寺观卷，却沿用旧名，不知何故。清亡，和州同知郑淦在头陀寺出家，法名灵照，民国大总统徐世昌为作小传，称之为“永嘉头陀山妙智寺僧”（《晚晴簃诗汇》卷一九八），又仍用雍正所改寺名。而在民间，密印、妙智，几乎俱绝于口，习惯只呼头陀寺。
迄至清代，又有授谦法师、授源法师、谛闲法师继席传法。本寺创建于唐代，兴盛于明清，沧桑几度，兴衰有时。据史记载，始则薄田数亩，堂屋二三楹，住僧亦不过数十人而已；盛时有良田五百余亩，殿宇数百间，讲席数百人。溯自历史，本自以禅宗开山，而后则以净土宗继之，而谛闲大师又专研天台教法而闻名。禅即是净，净必兼于教，故本寺又是禅、净、天台三宗兼宏的道场。
